Genetyczna ewolucja czerniaka z prekursorowych zmian cd 5

Wspólne zmiany genetyczne stanowiły pień drzewa filogenetycznego, podczas gdy prywatne zmiany określały gałęzie. Długość tułowia i gałęzi były skalowane na podstawie liczby mutacji somatycznych, jak w przykładowym przypadku (rysunek 1F). Korelacja wzorów mutacji z cechami histopatologicznymi
Ryc. 2. Rycina 2. Ewolucja genetyczna wszystkich przypadków. Mediana (kolorowe kółko) i zakres międzykwartylowy (kolorowa linia) ocen histopatologicznych są wyświetlane dla każdego obszaru, z nałożonymi odpowiednimi zmianami onkogennymi. Przypadki są uporządkowane zgodnie z etapem w momencie rozpoznania w przypadku zmiany prekursorowej. W dwóch przypadkach mutacja patogenna była obecna w linii płciowej. Promotor TERT nie był sekwencjonowany dla ośmiu przypadków oznaczonych gwiazdką. Podkreślone zmiany onkogenne wykazały indukowaną promieniowaniem ultrafioletowym sygnaturę mutacyjną. Amp oznacza amplifikację, delecję, przesunięcie ramki fs, hetero-heterozygotyczną, hom homozygotyczną i utratę heterozygotyczności LOH. Patrz rysunki S1 do S36 w Dodatku Dodatkowym 1, aby uzyskać szczegółowy opis każdego przypadku.
Wiele nowotworów melanocytowych można sklasyfikować jako łagodne lub złośliwe z wysokim stopniem zgodności między obserwatorami. Istnieje jednak szara strefa zmian pośrednich, które charakteryzują się nakładającymi się kryteriami morfologicznymi i mniejszą umową międzyobserwową. Obecnie nie wiadomo, czy takie zmiany stanowią prawdziwe jednostki biologiczne, czy tylko odzwierciedlają ograniczenia oceny histopatologicznej. Ryc. 2 pokazuje medianę i rozstęp międzykwartylowy ocen obserwatorów dla poszczególnych obszarów z każdego przypadku. Zgodnie z oczekiwaniami na krańcach spektrum osiągnięto wysoki stopień zgodności między obserwatorami, z szerszym zakresem w kategoriach pośrednich.
Rycina 3. Rycina 3. Wzory mutacji i obciążenia mutacyjnego na każdym etapie progresji.Panel A pokazuje rozkład mutacji szlaku aktywacji kinazy białkowej (MAPK) mitogenów, z warstwowaniem według etapu histologicznego. Panel B pokazuje obciążenie związane z mutacją punktową, mierzone na podstawie mutacji na megabazę (Mb) oraz na podstawie zmian liczby kopii (CNA), mierzonych zmianą proporcji genomu. Panel C pokazuje rozkład zmian TERT i CDKN2A przez CNA lub mutacje. Panel D pokazuje odsetek mutacji punktowych wywołanych promieniowaniem ultrafioletowym ([C / T] C do T). Panele E pokazują korelację pomiędzy obciążeniem mutacyjnym w obszarach czerniaka i ekspozycji na słońce, jak wynika z wieku pacjenta i miejsca anatomicznego, a panel F wykazuje taką samą korelację, jak wynika z elastozy słonecznej. Miejsca anatomiczne pogrupowano na podstawie ekspozycji na słońce, jak pokazano po prawej stronie panelu E. Elastozę słoneczną oceniano jak opisano wcześniej, 23 z przykładami po prawej stronie panelu F. BNLM oznacza niebieski, podobny do czerniaka czerniak, i DM desmoplastic melanoma.
Wszystkie 13 obszarów uznanych jednogłośnie za łagodne wykazało mutację BRAF V600E jako jedyną widoczną mutację patogenną (ryc. 2). Natomiast 19 z 21 obszarów sklasyfikowanych jako pośrednie przez co najmniej dwóch obserwatorów wykazało wiele patogennych mutacji. Pośrednie zmiany miały szersze spektrum inicjujących onkogenów niż jednoznacznie łagodne zmiany, w tym mutacje BRAF V600K lub K601E i NRAS (Figura 2 i Figura 3A).
[podobne: przychodnia pieczewo, lek na owsika bez recepty, procedury w gabinecie stomatologicznym ]